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Roche NimbleGen y Sigma-Aldrich empezar la colaboración de más de chip-chip de investigación

Published on April 23, 2009 at 12:38 AM

Roche NimbleGen y Sigma-Aldrich (Nasdaq: SIAL) han iniciado una colaboración para promover inmunoprecipitación de cromatina-en-microarray (chip-chip) la investigación mediante la alineación de sus dos tecnologías complementarias, Roche NimbleGen chip-chip de alta densidad de microarrays y GenomePlex por Sigma- Aldrich. En conjunto, las plataformas permiten a los investigadores a estudiar de manera eficaz el genoma completo de las interacciones entre la epigenética del ADN y las proteínas de unión al ADN para determinar las regiones del genoma que son transcripcionalmente activa o reprimida, así como los mecanismos que regulan estos procesos. Comprensión de la epigenómico fundamentales y vías de regulación genómica que fomentan el crecimiento celular normal y la diferenciación de los tejidos, así como los cambios en el control de regulación asociados con la enfermedad, es crucial para el desarrollo de fármacos que actúan sobre estas vías.

Para facilitar el flujo de trabajo de chip-chip, Roche NimbleGen y Sigma-Aldrich se publicarán los protocolos de chip-chip de investigación y brindar apoyo técnico a los investigadores de la integración de las dos tecnologías, así como del mercado co-sus productos complementarios.

Chip-chip es una poderosa herramienta que combina la cromatina immunoprecipitation (CHIP) con microarrays para entender las interacciones proteína-ADN. El paso chip despliega un anticuerpo específico contra una proteína reguladora de interés, lo que resulta en el enriquecimiento de los fragmentos de ADN unido a la proteína diana. Por lo general, estas fracciones de ADN se enriquecen en concentraciones muy bajas y tienen que ser amplificada para la detección. Las tecnologías de Sigma-Aldrich y NimbleGen Roche facilitar la efectiva chip-chip de investigación por hacer frente a dos obstáculos más importantes en el flujo de trabajo: una amplificación eficiente de las secciones específicas de ADN de alta resolución y detección de microarrays. Para los investigadores, GenomePlex es el método preferido para amplificar dirigidos pequeñas (menos de 200bp) fragmentos de ADN de una manera eficiente e imparcial. El genoma amplificado puede ser analizada en alta densidad Roche NimbleGen (hasta 2,1 millones de sondas por matriz), a largo matrices de oligonucleótidos, chip-chip, los más sensibles en el mercado, para estudiar las interacciones entre el ADN y las proteínas, tales como factores de transcripción, histonas y polimerasas.

"La tecnología de Sigma-Aldrich toda la amplificación del genoma es nuestro método de elección para la preparación de muestras de chips para análisis de microarrays. La alta reproducibilidad y eficacia de GenomePlex para amplificar muestras de chips de un pequeño número de células, en combinación con la sensibilidad excepcional de la NimbleGen Roche microarrays de alta densidad, que nos permite estudiar los patrones de la cromatina en pequeñas cantidades de tejidos normales y el cáncer ", dijo la Dra. Peggy Farnham, Profesor de Farmacología y Director Asociado de Genómica de la Universidad de California Davis.

Amplificación del genoma completo ofrece ventajas sobre otras técnicas de los investigadores se han basado en en el pasado. Por ejemplo, la ligadura mediada por PCR, una técnica muy utilizada para la preparación de ADN para el análisis de chip, a menudo hace que los investigadores de perder importantes puntos de unión. Con todo el genoma efectivamente amplificada por GenomePlex, el análisis de Roche NimbleGen matrices de alta densidad pueden revelar rara interacciones proteína-DNA con una elevada relación señal ruido y la sensibilidad.

Para más información sobre las tecnologías, por favor visite Sigma-Aldrich en www.sigma-aldrich.com/wga o NimbleGen Roche en www.nimblegen.com / productos / chip.

Sigma-Aldrich es una Ciencia de la Vida y la empresa líder de alta tecnología. Sus productos químicos orgánicos y bioquímicos y kits se utilizan en la investigación científica, incluyendo la investigación genómica y proteómica, biotecnología, desarrollo farmacéutico y como componentes clave en la fabricación de la tecnología farmacéutica, de diagnóstico y otros de alta. La empresa tiene clientes en compañías de ciencias de la vida, las instituciones universitarias y gubernamentales, hospitales, y en la industria. Más de un millón de científicos y tecnólogos utilizan sus productos. Sigma-Aldrich opera en 37 países y cuenta con 7.900 empleados en todo el mundo proporcionando un excelente servicio. Sigma-Aldrich se ha comprometido a acelerar el éxito del cliente a través de la Innovación y Liderazgo en Ciencias de la Vida, Alta Tecnología y Servicio. Para obtener más información acerca de Sigma-Aldrich, por favor visite su galardonado sitio Web en http://www.sigma-aldrich.com.

Roche NimbleGen es un líder innovador, fabricante y proveedor de una gama patentada de micromatrices de ADN, fungibles, instrumentos y servicios. Roche NimbleGen produce matrices de alta densidad de sondas de oligonucleótidos largos que proporcionan un mayor contenido de información y una mayor calidad de los datos necesarios para el estudio de la diversidad de variaciones genómicas y epigenómicas. El mejor rendimiento es posible gracias a propiedad Roche NimbleGen Maskless Array Synthesis (MAS), que utiliza el procesamiento digital de luz y fotoquímica rápida, de alto rendimiento para sintetizar oligonucleótidos de largo, de alta densidad de microarrays de ADN con la máxima flexibilidad. Para más información sobre Roche NimbleGen, por favor visite el sitio web de la compañía en www.nimblegen.com

Last Update: 5. October 2011 23:02

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