Posted in | Nanofluidics | Nanobusiness

Peneliti Temukan Digital Array Fluidigm dapat Mudah Disesuaikan dengan SNP Haplotyping

Published on December 9, 2009 at 4:43 AM

Sebuah poster teknis dari Fluidigm Eropa berjudul 'Cepat-molekul tunggal haplotyping pada pasien dengan penyakit sel sabit' laporan pada karya perintis Dr Stephen Menzel dan rekan-rekannya di Kings College (London), Sekolah Kedokteran.

Penyakit sel sabit adalah kondisi genetik yang menghancurkan disebabkan oleh mutasi gen globin beta pada kromosom 11p. Variasi genetik lain dapat menyebabkan bentuk ringan dari penyakit. Salah satu lokus pengubah tersebut telah dipetakan ke daerah intergenik antara HBS1L dan MYB (HMIP) pada kromosom 6q23.3. Ini lokus baru didominasi oleh blok haplotype 24-kb (HMIP-2) ditandai dengan 11 SNP. Untuk mengidentifikasi varian causitive dalam HMIP-2, para peneliti menggunakan Fluidigm BioMark ™ System dan Digital Array ™ Fluidic Integrated Circuit (IFC) teknologi untuk menyelidiki haplotipe SNP dalam serangkaian Afrika Barat dan pasien Afrika / Eropa.

Para peneliti menemukan bahwa Kings College array digital Fluidigm dapat dengan mudah disesuaikan dengan SNP haplotyping. Menerapkan digital array haplotyping para peneliti mampu fase tiga penanda SNP pada lokus dimodifikasi untuk penyakit sel sabit. Pekerjaan lebih lanjut menggunakan Sistem BioMark Fluidigm dan Digital Array IFC untuk memperluas dan lebih mencirikan haplotipe Afrika akan membantu mengidentifikasi varients causitive genetik pada lokus ini.

Salinan poster tersedia gratis untuk download dari http://www.fluidigm.com/pdf/posters/FLDM_MRKT00122.pdf

Sistem Fluidigm BioMark menggunakan teknologi IFC untuk mengurangi kompleksitas, meningkatkan throughput dengan presisi nanolitre dan memberikan penghematan biaya yang signifikan (kurang reagen dan sampel yang lebih kecil) untuk tinggi-throughput aplikasi PCR. Penelitian yang diuraikan di poster ini menggunakan Array 12,765 Fluidigm Digital, sebuah IFC unik yang mempekerjakan jaringan saluran terpadu dan katup untuk membagi campuran sampel dan reagen PCR ke 765 ulangan. Chip khusus dirancang untuk mengukur urutan target yang sangat akurat dan untuk mendeteksi kelimpahan rendah target yang berbeda dengan hanya pasangan basa-dari urutan wild type. Dengan tes konvensional mungkin target tersebut dinyatakan sulit untuk mendeteksi dalam sampel secara keseluruhan. Fluidigm juga menawarkan IFC 48,770 Array digital yang mampu pengujian hingga 48 sampel individu pada suatu waktu dan secara otomatis partisi masing-masing sampel ke set terpisah dari kamar 770 reaksi - memberikan total 36.960 reaksi simultan PCR digital.

Fluidigm mengembangkan, memproduksi dan memasarkan kepemilikan Fluidic Integrated Circuit (IFC) sistem yang secara signifikan meningkatkan produktivitas dalam penelitian ilmu kehidupan. IFCS Fluidigm memungkinkan kinerja simultan dari ribuan pengukuran biokimia canggih di menit volume sangat. Ini "sirkuit terpadu untuk biologi" dimungkinkan oleh miniaturising dan mengintegrasikan komponen penanganan cairan pada perangkat mikofluida tunggal microfabricated. Fluidigm IFC sistem, yang terdiri dari IFCS instrumentasi, perangkat lunak dan sekali pakai, throughput meningkat, menurunkan biaya dan meningkatkan sensitivitas dibandingkan dengan sistem laboratorium konvensional. Produk Fluidigm belum dibersihkan atau disetujui oleh Administrasi Makanan dan Obat untuk digunakan sebagai diagnostik dan hanya tersedia untuk digunakan penelitian.

Last Update: 28. November 2011 17:51

Tell Us What You Think

Do you have a review, update or anything you would like to add to this news story?

Leave your feedback
Submit