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Travail de Chercheurs sur les Outils De Calcul de Chimie pour l'Usage dans le Superordinateur des Eaux Bleues

Published on April 28, 2010 at 4:40 AM

Elles ne peuvent pas attendre pour faire la chimie de calcul aux calculs d'un quadrillion par seconde.

Mais il n'est pas tout qui calculant l'alimentation qui pilote des chercheurs de Laboratoire d'Université De L'Etat et d'Ames De trois Iowa pendant qu'ils développent la chimie de calcul au petascale. Piloter leur projet est la capacité de faire fonctionner des calculs complexes et améliore la science.

La « alimentation électrique de Petascale est exigée pour l'exactitude, » a dit Monica Lamm, un professeur adjoint de Condition de l'Iowa de scientifique chimique et biologique de bureau d'études et d'associé au Ministère De L'énergie des États-Unis le Laboratoire d'Ames Qui étudie le grippement moléculaire complexe. « Maintenant nous devons utiliser les méthodes qui sont moins précises et moins fiables. »

Theresa Windus, un professeur de Condition de l'Iowa de chimie et un associé du Laboratoire d'Ames, a dit que calculer plus haut l'alimentation effectuera une différence importante dans ses études des particules atmosphériques : « Ceci nous permet d'obtenir des résultats que nous n'avons avant jamais eus. »

La source d'alimentation calculante nouvelle et améliorée est les Eaux Bleues, un superordinateur qui est développé comme effort conjoint de l'Université de l'Illinois au l'Urbana-Champagne, son Centre National pour des Applications de Superinformatique, IBM, et Consortium de Great Lakes pour le Calcul de Petascale, qui comprend la Condition de l'Iowa.

On s'attend à ce que les Eaux Bleues soient le superordinateur le plus puissant dans le monde pour la recherche scientifique ouverte quand il vient en ligne en 2011. Ce sera le premier système de son genre pour supporter une performance de petaflop - calculs d'un quadrillion par seconde - sur un domaine des applications de scientifique et technique.

Les Eaux Bleues est supportées par le National Science Foundation et l'Université de l'Illinois.

Les chercheurs de Condition de l'Iowa Lamm, Windus et Note Gordon, Professeur Distingué et Frances M. Craig Chair en chimie, pharmacien de Laboratoire d'Ames et directeur supérieurs des Mathématiques Appliquées et des Sciences De Calcul Programme du laboratoire, aboutissent le travail de la Condition de l'Iowa pour développer le logiciel de calcul de chimie qui peut être évalué jusqu'aux systèmes informatiques de petascale. L'équipe de recherche inclut également Masha Sosonkina, un professeur agrégé de complément de l'informatique, d'élém. élect. et ingénierie informatique et un scientifique de Laboratoire d'Ames ; et Brett Présagent, le gestionnaire de développement de logiciel pour le projet d'Eaux Bleues au Centre National pour des Applications de Superinformatique.

Le travail des chercheurs est supporté par des concessions de plus de $1,6 millions du National Science Foundation.

Les chercheurs de Condition de l'Iowa travaillent pour évaluer deux codes du logiciel de calcul de chimie pour l'usage sur les Eaux Bleues et ses milliers de compilateurs et de connexions haut débit parallèles. (« Vous ne mettez pas simplement un CD dans l'ordinateur et le coup installent, » Windus a dit.) Un des indicatifs est GAMESS appelé et a été développé par l'organisme de recherche de Gordon à la Condition de Laboratoire et de l'Iowa d'Ames ; l'autre est NWChem, pour lequel Windus était le révélateur de plomb quand il était au Ministère De L'énergie des États-Unis le Laboratoire National Du Nord-ouest Pacifique Dans Richland, Washington. On s'attend à ce que l'alimentation calculante des Eaux Bleues aide le logiciel pour livrer mieux, des réponses plus précises à trois problèmes particuliers de recherches qui avaient trop de calcul exigé de faire des calculs complets avec les outils de recherches actuels.

Lamm étudie comment les dendrimers (grands polymères avec beaucoup de branchements) grippent aux ligands (de plus petites molécules qui grippent avec d'autres molécules pour former de plus grands composés). Une meilleure compréhension du grippement a pu avoir des applications en technologies de santé telles que l'accouchement et le traitement des eaux de médicament.

Windus étudie des aérosols dans l'ambiance et comment les particules minuscules se développent au niveau moléculaire. Il a dit qu'une meilleure compréhension des aérosols est importante pour comprendre la chimie de l'ambiance. Il utilise NWChem pour la recherche.

Gordon étudie la dynamique moléculaire de l'eau parce que beaucoup d'aspects de son comportement ne sont pas très bien compris. Pour faire ses études, il emploie une méthode de calcul qui permet à des chercheurs d'examiner un grand système moléculaire en le divisant des éclats. Cela permet à des chercheurs d'effectuer des calculs plus rapides tout en mettant à jour des résultats exacts. La méthode est seulement disponible sur l'outil de calcul de chimie de GAMESS développé par Gordon et son organisme de recherche.

Lamm a dit il espère que le projet d'Eaux Bleues aidera l'Iowa À Indiquer des chercheurs pour déménager leurs projets en avant.

« Un problème de chimie de calcul a été demander ce que calculer l'alimentation est disponible et comment pouvons nous simplifier la science pour l'ordinateur, » lui a dit. « Maintenant nous avons une occasion de faire nos problèmes la bonne voie. »

Source : http://www.iastate.edu/

Last Update: 12. January 2012 22:41

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