Site Sponsors
  • Oxford Instruments Nanoanalysis - X-Max Large Area Analytical EDS SDD
  • Strem Chemicals - Nanomaterials for R&D
  • Park Systems - Manufacturer of a complete range of AFM solutions
Posted in | Nanomaterials | Dendrimers

研究者はブルーウォーターズのスーパーコンピュータで使用するための計算化学ツール上で作業

Published on April 28, 2010 at 4:40 AM

彼らは、毎秒ペタフロップスの計算では計算化学を行うのを待つことはできません。

しかし、それは彼らがペタスケールで計算化学の開発として3つのアイオワ州立大学とエイムズ研究所の研究者を運転しているすべてのそのコンピューティングパワーはありません。彼らのプロジェクトを駆動すると、複雑な計算を実行し、より良い科学を行う機能です。

"ペタスケール電力は精度を要求され​​る、"モニカLammの、複雑な分子結合を研究するエネルギーのエイムズ研究所の米国エネルギー省の化学と生物工学と関連付ける科学のアイオワ州立助教授。 "今、私たちは、あまり正確で信頼性が低い方法を使用する必要があります。"

テレサWindus、化学とエイムズ研究所の助教授のアイオワ州立教授は、より高いコンピューティングパワーは、大気中の粒子の彼女の研究に大きな変化をもたらすと述べた:"これは、我々が前に持っていたことがない結果を取得することができます。"

新しく改良されたコンピューティングパワーの源はブルーウォーターズ、アーバナシャンペーン校、スーパーコンピューティングアプリケーション、IBM、およびペタスケール計算のための五大湖コンソーシアムのためのナショナルセンター、イリノイ大学の共同プロジェクトとして開発されているスーパーコンピュータです。これは、アイオワ州立が含まれています。

ブルーウォーターズは、それが2011年にオンラインになったときに開いている科学研究のための世界で最も強力なスーパーコンピュータであると予想される。一秒間兆の計算 - - 科学と工学のアプリケーションの範囲でのそれは1ペタフロップスの性能を維持するために、その種の最初のシステムとなります。

ブルーウォーターズは、国立科学財団、イリノイ大学でサポートされています。

アイオワ州立の研究者ラム、Windusとマークゴードン、化学の名誉教授とフランシスM.クレイグ議長、エイムズ研究所上級化学とラボの応用数学と計算科学プログラムのディレクターは、ことができる計算化学ソフトウェアを開発するためにアイオワ州立の仕事をリードしているペタスケールコンピューティングシステムにスケールアップ。とブレットボード、米国立スーパーコンピュータ応用センターでブルーウォーターズプロジェクトのソフトウェア開発マネージャー、研究チームはまた、マーシャ、電気およびコンピュータ工学とエイムズ研究所の科学者のSosonkina、コンピューターサイエンスの非常勤助教授を、含まれています。

研究者の仕事は、全米科学財団から以上の160万ドルの補助金によってサポートされています。

アイオワ州立の研究者はブルーウォーターズと並列プロセッサと高速接続のその何千もの上で使用するための2つの計算化学ソフトウェアのコードをスケールアップに取り組んでいます。 ("あなたはちょうどコンピュータとヒットのインストールCDを挿入していない、"Windusは言った。)コードのうちの1つGAMESSと呼ばれ、エイムズ研究所、アイオワ州立大学でゴードンの研究グループによって開発された、他のはNWChemです、そのための彼女はブルーウォーターズのコンピューティングパワー、ソフトウェアが非常にあった3つの特定の研究課題により良い、より正確な答えを提供できるように期待されるリッチランド、ワシントン州のエネルギーのパシフィックノースウェスト国立研究所米国エネルギー省にいたときにWindusはリード開発者だった計算現在の研究のツールを使って本格的な計算を実行する要求。

ラムは、どのようにデンドリマー(多くの支店を持つ大規模なポリマー)配位子(大きな複合体を形成するために他の分子と結合する小さな分子)へのバインドを検討している。バインディングをよりよく理解するには、薬物送達や水処理などの医療技術のアプリケーションを持つことができます。

Windusは、大気中のエアロゾルを検討しているとどのように小さな粒子が分子レベルで成長する。彼女は、エアロゾルの理解は、大気の化学的性質を理解する上で重要であると述べた。彼女は研究のためのNWChemを利用している。

その行動の多くの側面が非常によく理解されていないので、ゴードンは水の分子動力学を研究しています。彼の研究を行うために、彼は研究者が分割して断片にして大分子システムを見ることができます計算メソッドを使用している。それは正確な結果を維持しながら、研究者が迅速に計算を行うことができます。方法は、ゴードンと彼の研究グループによって開発されたGAMESS計算化学ツールでのみ使用可能です。

ラムは、彼女はブルーウォーターズプロジェクトはアイオワ州立の研究者が先に自分のプロジェクトを動かすに役立つことを望んでいると話す。

"計算化学の問題は、コンピューティングパワーが利用可能であり、どのように我々はコンピュータのための科学を簡素化することができるかを問うている、"彼女は言った。 "今、私たちは私たちの問題は正しい方法を行うチャンスがある。"

ソース: http://www.iastate.edu/

Last Update: 27. October 2011 18:26

Tell Us What You Think

Do you have a review, update or anything you would like to add to this news story?

Leave your feedback
Submit