Site Sponsors
  • Park Systems - Manufacturer of a complete range of AFM solutions
  • Strem Chemicals - Nanomaterials for R&D
  • Oxford Instruments Nanoanalysis - X-Max Large Area Analytical EDS SDD
Posted in | Nanomaterials | Dendrimers

De Onderzoekers Werken aan de ComputerHulpmiddelen van de Chemie voor Gebruik in de Blauwe Supercomputer van Wateren

Published on April 28, 2010 at 4:40 AM

Zij kunnen niet wachten om computerchemie bij quadrillion berekeningen per seconde te doen.

Maar het is niet al dat rekencapaciteit die drie Iowa van de Universiteit en Ames van de Staat de onderzoekers drijft van het Laboratorium aangezien zij computerchemie bij petascale ontwikkelen. Het Drijven van hun project is de capaciteit om complexe berekeningen in werking te stellen en beter wetenschap.

„De macht Petascale wordt vereist voor nauwkeurigheid,“ bovengenoemd Monica Lamm, een hulpprofessor van de Staat van Iowa van chemische en biologische techniek en verwante wetenschapper bij het Ames van het Ministerie van de V.S. van Energie Laboratorium dat complexe moleculaire band bestudeert. „Nu moeten wij methodes gebruiken die.“ minder nauwkeurig en minder betrouwbaar zijn

Theresa Windus, een professor van de Staat van Iowa van chemie en een vennoot van het Ames Laboratorium, zeiden de hogere rekencapaciteit een groot verschil in haar studies van atmosferische deeltjes zal maken: „Dit staat ons toe om resultaten te krijgen die wij.“ voordien nooit hebben gehad

De bron van de nieuwe en betere rekencapaciteit is Blauwe Wateren, een supercomputer die als gezamenlijke inspanning van de Universiteit van Illinois bij Urbana-Open vlakte, zijn Nationaal Centrum voor Supercomputing Toepassingen, IBM, en het Grote Consortium van Meren voor Berekening Petascale wordt ontwikkeld, die de Staat van Iowa omvat.

De Blauwe Wateren zouden de krachtigste supercomputer in de wereld voor open wetenschappelijk onderzoek moeten zijn wanneer het online in 2011 komt. Het zal het eerste systeem van zijn soort zijn om één petaflopprestaties - één quadrillion berekeningen per seconde - op een waaier van wetenschap en techniektoepassingen te ondersteunen.

De Blauwe Wateren wordt gesteund door de Nationale Stichting van de Wetenschap en de Universiteit van Illinois.

De onderzoekers van de Staat van Iowa Lamm, Windus en Teken Gordon, Onderscheidden Professor en Frances M. Craig Chair in chemie, Ames de hogere chemicus van het Laboratorium en directeur van de Toegepaste Wiskunde van het laboratorium en het ComputerProgramma van Wetenschappen, brengt het werk van de Staat van Iowa ertoe om computerchemiesoftware te ontwikkelen die tot petascale gegevensverwerkingssystemen kan worden geschraapt. Het onderzoeksteam omvat ook Masha Sosonkina, een toevoegsel verwante professor van computerwetenschap, van elektro en computertechniek en een Ames wetenschapper van het Laboratorium; en Brett Voorspelt, de manager van de softwareontwikkeling voor het Blauwe project van Wateren op het Nationale Centrum voor Supercomputing Toepassingen.

Het werk van de onderzoekers wordt gesteund door toelagen van meer dan $1.6 miljoen van de Nationale Stichting van de Wetenschap.

De onderzoekers van de Staat van Iowa werken aan schaal omhoog twee computercodes van de chemiesoftware voor gebruik aan Blauwe Wateren en zijn duizenden parallelle bewerkers en hoge snelheidsaanslutingen. („U zet niet alleen CD in de computer en de klap installeert,“ bovengenoemde Windus.) Één van de codes wordt genoemd GAMESS en door het onderzoeksteam van Gordon bij Ames Laboratorium en de Staat van Iowa ontwikkeld; andere is NWChem, waarvoor Windus de hoofdontwikkelaar was toen zij bij het Nationale Laboratorium van het Noordwesten van het Ministerie van de V.S. van Energie Vreedzame in Richland, Was was. De rekencapaciteit van Blauwe Wateren zou moeten de software helpen, nauwkeurigere antwoorden aan drie specifieke onderzoekproblemen beter leveren die te met behulp van computer hebben geëist om volledige berekeningen met huidige onderzoekhulpmiddelen te doen.

Lamm bestudeert hoe dendrimers (grote polymeren met vele takken) aan ligands binden (kleinere molecules die met andere molecules aan vorm grotere complexen binden). Een beter inzicht in de band kon toepassingen in gezondheidstechnologieën zoals druglevering en waterbehandeling hebben.

Windus bestudeert aërosols in de atmosfeer en hoe de uiterst kleine deeltjes op het moleculaire niveau groeien. Zij zei een beter inzicht in aërosols voor het begrip van de chemie van de atmosfeer belangrijk is. Zij gebruikt NWChem voor het onderzoek.

Gordon bestudeert de moleculaire dynamica van water omdat vele aspecten van zijn gedrag niet zeer goed worden begrepen. Om zijn studies te doen, gebruikt hij een computermethode die onderzoekers om een groot moleculair systeem toestaat te bekijken door het in fragmenten te verdelen. Dat staat onderzoekers toe om snellere berekeningen te maken terwijl het handhaven van nauwkeurige resultaten. De methode is slechts beschikbaar op het GAMESS computerchemiehulpmiddel dat door Gordon en zijn onderzoeksteam wordt ontwikkeld.

Lamm zei zij hoopt het Blauwe project van Wateren de onderzoekers zal helpen van de Staat van Iowa hun projecten vooruit bewegen.

Een „probleem van computerchemie heeft welke rekencapaciteit beschikbaar is en hoe wij de wetenschap voor de computer kan vereenvoudigen,“ zij zei gevraagd. „Hebben wij Nu een kans om onze problemen te doen de juiste manier.“

Bron: http://www.iastate.edu/

Last Update: 12. January 2012 22:39

Tell Us What You Think

Do you have a review, update or anything you would like to add to this news story?

Leave your feedback
Submit