Site Sponsors
  • Strem Chemicals - Nanomaterials for R&D
  • Park Systems - Manufacturer of a complete range of AFM solutions
  • Oxford Instruments Nanoanalysis - X-Max Large Area Analytical EDS SDD
Posted in | Nanomaterials | Dendrimers

在计算化学工具的研究员工作用于大海巨型计算机

Published on April 28, 2010 at 4:40 AM

他们不可能等待执行计算化学在百万之四次方计算每秒。

但是计算能力驱动三爱荷华州立大学和艾姆斯实验室研究员的它不是所有,当他们开发计算化学在 petascale。 驱动他们的项目是这个能力运行复杂计算,并且改善科学。

“Petascale 功率对于准确性是必需的”,衣阿华状态助理教授说莫妮卡 Lamm,美国能源部的化工和生物工程和关联科学家学习复杂分子捆绑的艾姆斯实验室。 “现在我们必须使用是较不准确和较不可靠的方法”。

特里萨 Windus、化学衣阿华状态教授和关联艾姆斯实验室,说更高计算能力在她的大气微粒的研究中将产生大变化: “这允许我们取得我们以前从未有的结果”。

新和被改进的计算能力的来源是大海,被发展作为伊利诺伊大学共同努力尔般那平原、其国家超级电脑应用中心, IBM 和大湖财团的 Petascale 计算的,包括衣阿华状态的巨型计算机。

当它在线在 2011年时,来大海预计是在世界的最强大的巨型计算机开放科学研究的。 它将是持续一 petaflop 性能的其种类第一个系统 - 每第二的一百万之四次方计算在科学和工程应用的范围。

大海由国家科学基金会和伊利诺伊大学支持。

衣阿华状态研究员 Lamm、 Windus 和标记哥顿,著名的教授和弗朗西丝 M. 化学、艾姆斯实验室实验室的应用数学和计算科学程序的高级化学家和主任的克雷格 Chair,导致衣阿华状态的工作开发可以被称至 petascale 计算系统的计算化学软件。 研究小组也包括 Masha Sosonkina,附属副教授计算机科学,电子和计算机工程和艾姆斯实验室科学家; 并且 Brett 预示,大海的软件开发经理设想在国家超级电脑应用中心。

研究员的工作由授予超过 $1.6 百万支持从国家科学基金会。

衣阿华状态研究员工作按比例提高计算化学软件编码为在大海和其千位的使用并行处理器和高速连接数的二。 (“您仅仅不放 CD 到计算机,并且命中安装”, Windus 说。) 其中一个编码称 GAMESS 和由哥顿的在艾姆斯实验室和衣阿华状态的研究小组开发; 其他是 NWChem, Windus 是线索开发员,当她是在美国能源部和平的西北国家实验室在 Richland,华盛顿。 大海的计算能力预计帮助这个软件更好传送,更加准确的答复到太计算上需求执行与当前研究工具的全方位计算的三个特定研究问题。

Lamm 学习 dendrimers (与许多分行的大聚合物) 如何束缚对配合基 (束缚以其他分子形成更大的复杂) 的更小的分子。 对捆绑的更好的了解在健康技术能有应用例如药物发运和水处理。

Windus 学习在气氛的湿剂,并且微粒子如何增长在这个分子级别。 她说对湿剂的更好的了解对了解气氛的化学是重要。 她为这个研究使用 NWChem。

因为其工作情况的许多方面没有很好了解,哥顿学习水分子动力学。 要执行他的研究,他使用允许研究员调查一个大分子系统通过分裂它片段的一个计算方法。 那允许研究员做更加快速的计算,当维护准确结果时。 这个方法只是可用的在哥顿和他的研究小组开发的 GAMESS 计算化学工具。

Lamm 说她希望大海项目将帮助衣阿华指明研究员移动前面他们的项目。

“计算化学的问题有是的要求什么计算能力是可用,并且如何可以我们简化计算机的科学”,她说。 “现在我们有一个机会执行我们的问题正确的方式”。

来源: http://www.iastate.edu/

Last Update: 12. January 2012 07:16

Tell Us What You Think

Do you have a review, update or anything you would like to add to this news story?

Leave your feedback
Submit