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Posted in | Nanoanalysis

Agilent Technologies lance une plateforme biopuces Nouvelle recherche cytogénétique

Published on October 12, 2010 at 7:06 AM

Agilent Technologies Inc (NYSE: A) a présenté aujourd'hui le SurePrint G3 homme CGH microarray SNP + plate-forme, un système innovant pour l'analyse simultanée de modifications chromosomiques nombre de copies et de copier-neutre aberrations.

Le système permet aux chercheurs d'étudier la base génétique des troubles du développement ainsi que de nombreux cancers.

C'est la seule plate-forme de deux couleurs CGH qui peut détecter la perte d'hétérozygotie / disomie uniparentale (LOH / UPD) avec 5 - 10 mégabases résolution.

SurePrint G3 + CGH microréseaux SNP

"Enfin, nous avons un tableau qui a optimale de détection du nombre de copies, y compris le potentiel d'exon par exon couverture, qui a également SNP pour détecter l'absence d'hétérozygotie [AOH] causée par l'UPD ou de consanguinité», a déclaré le Dr Arthur Beaudet, président du Département de génétique humaine et moléculaire au Baylor College of Medicine.

«Nous sommes ravis d'être l'ajout de sondes SNP à notre largement utilisé CGH arrays, résultant en un outil puissant et très efficace pour détecter les changements du nombre de copies et de copier-neutre LOH / UPD, offrant un profil plus complet des aberrations génomiques», a déclaré Anniek De Witte, chef de produit Agilent, Microarrays CGH. «Résolution, la précision et la sensibilité se poursuivre au même niveau élevé que les chercheurs en sont venus à attendre de notre offre de CGH."

L'Agilent SurePrint G3 + CGH tableaux SNP sont disponibles en catalogue et dessins personnalisés, similaire à notre gamme actuelle des formats. Microarrays personnalisés peuvent être facilement conçu en eArray, Agilent gratuitement l'application Web, ou eArray XD, la version de bureau.

Tant le catalogue SurePrint CGH + SNP 4x180K et 2x400K puces mesurent environ 60 000 SNP, résultant en environ 5 - 10 mégabases de résolution pour LOH / UPD de détection à travers le génome entier. Les sondes CGH environ 120.000 sur les tableaux 4x180K catalogue se composent des Normes internationales pour l'ensemble cytogénomique Consortium tableaux de jeu de sondes 8x60K version et une sondes supplémentaires 60000 épine dorsale. Les sondes environ 300.000 CGH array sur le catalogue sont 2x400K gènes et l'exon-biaisée, en se concentrant sur la couverture des plus importantes régions du génome.

La CGH SurePrint G3 + microréseaux SNP utiliser le haut-débit identiques workflow que le courant ne microarrays CGH-afin qu'ils puissent être simplement et efficacement intégrés dans la recherche en cytogénétique. Logiciel Agilent Workbench génomique compliments analyses tableau en employant de nouveaux algorithmes pour déterminer les changements du nombre de copies en utilisant des sondes CGH, pour mesurer le nombre de copies allèle-spécifique des sondes SNP, et de localiser les régions de LOH / UPD. Le logiciel permet l'analyse simultanée de CGH et SNP côtés des données métriques CQ pour haute confiance en l'évaluation des données.

Source: http://www.agilent.com/

Last Update: 9. October 2011 22:56

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