Site Sponsors
  • Oxford Instruments Nanoanalysis - X-Max Large Area Analytical EDS SDD
  • Park Systems - Manufacturer of a complete range of AFM solutions
  • Strem Chemicals - Nanomaterials for R&D
Posted in | Nanomedicine | Microscopy

Het Genoom van de Muis dat wordt Gevonden om uit 10 NMChromatin Vezels Te Bestaan

Published on October 5, 2012 at 5:22 AM

De Wetenschappers in Canada en de Verenigde Staten hebben driedimensionele weergavetechnieken gebruikt om een al lang bestaand debat over te regelen hoe DNA en de structurele proteïnen in chromatin vezels worden verpakt.

Dit toont DNA die in 10 NMchromatin vezels wordt verpakt. Krediet: Uta Mackensen, EMBO

De onderzoekers, de van wie bevindingen in EMBO rapporten worden gepubliceerd, openbaren dat het muisgenoom bestaat uit 10 NMchromatin vezels maar geen bewijsmateriaal voor de bredere 30 NMvezels vond die eerder om belangrijke componenten van de architectuur van DNA werden verondersteld te zijn.

„DNA is een uitzonderlijk lange molecule die verscheidene meter in lengte kan bereiken. Dit betekent het in een hoogst compacte staat moet worden verpakt om binnen de beperkte ruimte van de celkern te passen,“ bovengenoemd David bazett-Jones, Hogere Wetenschapper bij het Ziekenhuis voor Zieke Kinderen, Toronto, en Professor bij de Universiteit van Toronto, Canada. „In de afgelopen decennia, hebben de wetenschappers structurele modellen voor chromatin organisatie goedgekeurd waar DNA eerst verpakt rond proteïnen in nucleosomes is. In één mogelijk model, is de bundel van het herhalen nucleosomes verder verpakt in een vezel van hoog-orde dikke 30 NM. In een tweede model, wordt de 30 NMvezel niet vereist om DNA samen te persen. De Verschillen tussen deze modellen hebben implicaties voor de manier de cel de transcriptie van genen.“ regelt

Chromatin is het complex van DNA en proteïnen dat de fundamentele constituent van chromosomen in de kern van de cel is. De onderzoekers gebruikten een combinatie technieken van de overzichtsweergave, in dit geval energie spectroscopische weergave en elektronentomografie, om high-resolution driedimensionele beelden van chromatin in muiscellen te produceren. Deze benadering staat voor visuele analyse van chromatin vezels zonder de behoefte toe om chemische agenten toe te voegen om het contrast van beelden te verbeteren.

„Onze resultaten openbaarden dat het 30 NMchromatin vezelmodel niet verenigbaar met de structuur is die wij in onze driedimensionele spectroscopische beelden hebben gevonden,“ bovengenoemde bazett-Jones. „Men dacht eerder dat de overgang tussen dunnere en dikkere vezels een verandering van een actieve aan onderdrukte staat van chromatin vertegenwoordigde. Nochtans, brengt ons onvermogen om 30 NMvezels in het muisgenoom te ontdekken ons ertoe om te besluiten dat de transcriptional machines wijdverspreide toegang tot DNA hebben die in chromatin vezels wordt verpakt.“

De resultaten zijn verenigbaar met recente studies van het menselijke genoom die suggereren dat ongeveer 80% van het genoom elementen bevat die met biologische functie verbonden zijn. De Toegang tot versterkers, promotors en andere regelgevende opeenvolgingen op zulk een brede gebied van het genoom betekent dat elk van deze plaatsen toegankelijk moeten zijn. Het 10 NMmodel van chromatin vezels verleent voldoende toegang tot DNA om potentiële doelplaatsen toe te laten om worden bereikt. Het 30 NMmodel zou dergelijke wijdverspreide toegang niet aanpassen.

De onderzoekers bieden verscheidene redenen voor de observatie van bredere vezels in vroegere studies aan. In sommige gevallen, kunnen de voorwaarden buiten de cel, met inbegrip van die gebruikt in vroegere studies waar chromatin werd gehaald uit de cel, tot structurele artefacten geleid hebben. Voor enkele vroegere spectroscopische studies, kan het zelfs een kwestie van slechte resolutie van bestaande 10 NMvezels zijn.

Bron: http://www.embo.org/

Last Update: 5. October 2012 08:54

Tell Us What You Think

Do you have a review, update or anything you would like to add to this news story?

Leave your feedback
Submit