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O Estudo Levanta a Dúvida na Viabilidade do Genoma Funcional de Nanopore que Arranja Em Seqüência o Dispositivo

Published on October 18, 2012 at 8:51 AM

A reivindicação que a tecnologia do nanopore é à beira de fazer a análise do ADN tão rápida e barata que o genoma inteiro de uma pessoa poderia ser arranjado em seqüência apenas em actas e em uma fracção do custo de métodos comerciais disponíveis, conduziu ao interesse académico, industrial, e global da opressão.

Mas uma revisão pelo físico Do Nordeste Meni Wanunu da Universidade, publicado em uma edição especial no nanopore que arranja em seqüência na Física de Revisões da Vida, questiona se os obstáculos técnicos restantes podem ser superados para criar um dispositivo comercial praticável, facilmente produzido.

No começo desse ano Tecnologias de Oxford Nanopore, uma das empresas de abertura de caminhos de arranjar em seqüência descobertas, anunciadas que esperam a costa do nanopore que arranja em seqüência para conseguir um genoma 15 minuto em 2014 a custo de $1.500. Este é uns muitos distintos dos $10 milhões que custem para arranjar em seqüência um genoma inteiro apenas 5 anos há.

Desde Que a ideia de arranjar em seqüência do nanopore era em meados de 1990 s primeiramente propor, os avanços enormes foram feitos. A ideia básica é excessivamente simples: uma única rosca do ADN é passada com molécula-feita sob medida minúscula furo-ou nanopore-e as várias bases do ADN estão identificadas em ordem enquanto se movem através do poro.

Mas de acordo com Wanunu, a realidade da tecnologia de manipulação baseada nos poros tão minúsculos que 25.000 deles podem caber de lado a lado em um cabelo humano provou uma tarefa intimidante. O desafio principal foi retardar para baixo o processo e controlar o movimento da costa do ADN através do poro em uma taxa lenta bastante para fazer bases individuais do ADN legíveis e úteis. Uma aproximação nova usando movimento enzima-controlado, desenvolvido para superar este problema, tem seus próprios inconvenientes incluir a actividade de enzima deficiente tendo por resultado processivity limitado e movimento dianteiro-reverso descontrolado.

Um Outro dilema principal foi se a proteína ou os poros de circuito integrado fornecem a técnica a mais prometedora. No início, as proteínas porosas naturais foram investigadas. Mas no 2000s adiantado, anunciado como a melhores capacidade e flexibilidade de oferecimento, os vários nanopores de circuito integrado feitos do silicone ou o graphene foram testados. “Desde os canais lipido-encaixados da proteína e nanopores de circuito integrado tenha inconvenientes, será interessante ver que dispositivo, ou que combinação de dispositivos, estará disponível nos próximos anos, eventualmente,” Wanunu diz.

Neste tempo há ainda muitos obstáculos a superar, ele adiciona, incluindo a incapacidade dos nanopores fornecer toda a informação espectroscópica sobre a identidade de uma molécula, incertezas sobre se a translocação ocorre em uma velocidade constante, e as complicações da obstrução do poro.

Escrevendo em um comentário publicado na mesma edição, John Kasianowicz do National Institute of Standards and Technology nos E.U., um pioneiro no campo, concorda que a abundância dos desafios permanece: “Há certamente ainda muitos problemas a endereçar a fim permitir dispositivos de detecção nanopore-baseados eletrônicos práticos. Contudo, melhor compreendendo a estrada já desenvolvida neste campo emergente, a viagem parecerá esperançosamente um pouco de menos desanimada,”

Em um comentário final na revisão de Wanunu, o fundador e o Director de Oxford Nanopore, Hagan Bayley, anticipam ao futuro: “No longo prazo, usando os poros de circuito integrado… pode ser possível ler seqüências do ADN em microssegundos um pouco do que milissegundos pela base. Isto poderia ser feito usando correntes da escavação de um túnel ou outras características das bases do ADN para que graphene-com seu eletrônico incomum propriedade-puderam depois que a revelação adicional fornece uma carcaça superior e em assim que fazendo entregue um outro pulo maciço para a frente sobre uma década de progresso inaudito.”

Source: http://www.elsevier.com

Last Update: 18. October 2012 09:47

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