Site Sponsors
  • Strem Chemicals - Nanomaterials for R&D
  • Park Systems - Manufacturer of a complete range of AFM solutions
  • Oxford Instruments Nanoanalysis - X-Max Large Area Analytical EDS SDD

Изучение Поднимает Сомнение на Выживаемости Функционального Генома Nanopore Sequencing Прибор

Published on October 18, 2012 at 8:51 AM

Заявка что технология nanopore на краю делать анализ ДНА настолько быстрым и дешевым который геном персоны весь смог быть sequenced в как раз минутах и на фракция цене доступных коммерчески методов, приводила к в подавляющие академичном, промышленно, и глобальные интересе.

Но просмотрение Северовосточным физиком Meni Wanunu Университета, опубликованным в специальном выпуске на nanopore sequencing в Физике Просмотрений Жизни, спрашивает ли остальные технические барьеры можно отжать для того чтобы создать выполнимый, легко произведенный коммерчески прибор.

Более Раньше этого Технологии Оксфорда Nanopore года, одна из pioneering компаний sequencing открытия, объявленных что они надеются стренгу nanopore sequencing для того чтобы достигнуть мельчайшего генома 15 к 2014 на цене $1.500. Это большая разница от $10 миллионов оно стоило для того чтобы sequence весь геном как раз 5 лет тому назад.

В Виду Того Что идея sequencing nanopore сперва была предложена в средних 1990s, огромные выдвижения были сделаны. Основная мысль exceedingly проста: однозаходная резьба ДНА пропущена через малюсенько молекул-определять размер отверсти-или nanopore-и различные основания ДНА определены в последовательности по мере того как они двигают через пору.

Но согласно Wanunu, реальность манипулируя технологии основанная на стороне пор настолько малюсенькой что 25.000 из их могут приспосабливать сторону - мимо - на человеческих волосах доказывала грандиозную задачу. Главным образом возможность замедлять процесс вниз и управила движением стренги ДНА через пору на тарифе медленном достаточно для того чтобы сделать индивидуальные основания ДНА четкой и годной к употреблению. Новый подход используя энзим-контролируемое движение, начатое для того чтобы отжать эту проблему, имеет свои собственные недостатки включая плохую протеиновую активность приводящ к в лимитированном processivity и бесконтрольном передн-обратном движении.

Другая главная дилемма обеспечивают ли протеин или полупроводниковые поры самый перспективнейший метод. Вначале, естественно - происходя пористые протеины были расследованы. Но в предыдущем 2000s, heralded как предлагая более лучшие возможность и гибкость, были испытаны различные полупроводниковые nanopores сделанные из кремния или graphene. «С и липид-врезанных каналов протеина и полупроводниковых nanopores имейте недостатки, будет интересно увидеть который прибор, или какие приборы сочетание из, будут доступны в ближайших годах, если любые,», то Wanunu говорит.

В это время все еще много барьеров, котор нужно отжать, он добавляют, включая невозможность nanopores обеспечить любую спектроскопическую информацию о тождественности молекулы, неопределенностях о происходит ли транслокация на неизменяемой скорости, и усложнениях закупоривать поры.

Пишущ в комментарии опубликованном в таком же вопросе, Джон Kasianowicz от Национального института стандартов и технологий в США, пионер в поле, соглашается что множество возможностей остает: «Деиствительно все еще много проблем, котор нужно адресовать для того чтобы включить практически электронные nanopore-основанные воспринимая приборы. Однако, более лучше понимать дорогу уже развитую в этом насцентном поле, путешествие многообещающе появится немногая более менее ошеломительное,»

В окончательном комментарии на просмотрении Wanunu, основатель и Директор Оксфорда Nanopore, Hagan Bayley, смотрят вперед к будущему: «В долгосрочном, путем использование полупроводниковых пор… может быть возможно прочитать последовательности ДНА на микросекундах вернее чем миллисекунды в основание. Это смогло быть сделано путем использование течений прокладывать тоннель или других характеристик оснований ДНА для которые graphene-с свое необыкновенное электронным свойств-могли после того как дополнительное развитие обеспечит главный субстрат и в поэтому делающ поставьте другое массивнейшее перескакивание вперед na górze декады беспрецедентного прогресса.»

Источник: http://www.elsevier.com

Last Update: 18. October 2012 09:47

Tell Us What You Think

Do you have a review, update or anything you would like to add to this news story?

Leave your feedback
Submit