El Modelo Innovador Proporciona a Nuevos Discernimientos en la Secuencia de Nanopore

Published on November 9, 2012 at 6:46 AM

Mientras Que progresa la nanotecnología, llega a ser cada vez más importante conocer detalladamente la dinámica del nanoworld (el mundo en la escala de un millonésima de un milímetro). ¿Qué suceso, por ejemplo, cuando intentamos impulsar un polielectrolito (una cadena larga de moléculas eléctricamente cargadas, tales como DNA) a través de un nanopore si los nudos hacen el proceso del desplazamiento atascar?

No es una pregunta insustancial, porque ahora una nueva DNA que ordena método electroquímico para analizar cada hilo impulsándolo a través de un nanopore, se está convirtiendo. Puesto Que esos hilos tienden a enredar hacia arriba si son muy largos, Ángel Rosa de la Escuela Internacional para los Estudios Avanzados y sus colegas se estableció para estudiar la dinámica de este desplazamiento teóricamente, realizando una simulación.

El modelo elegido por los científicos ha mostrado que la interferencia no es causada por la simple presencia del nudo, pero por el lazo entre la fricción y la fuerza aplicada para impulsar la molécula en la separación. “El resultado no es tan obvio si está comparado a qué suceso en un nivel macro,” explicó a Cristian Micheletti, investigador en SISSA y uno de los autores del papel publicado en Cartas Físicas de la Revista. Los “Nudos introducen una fricción efectiva que los aumentos con la fuerza y los tirones aplicados el polímero a la otra cara del nanopore. El Desplazamiento se para solamente encima de una fuerza del umbral”.

“Según lo que observamos en la simulación, evitar la obstrucción del poro y el alto del desplazamiento, la fuerza aplicada debe ser controlada, sin la tracción de demasiado” Rosa explicado.

Este estudio es apenas un primer paso de progresión. Para los detalles cuantitativos en exámenes más profundizados de este proceso (cuáles este umbral es y cómo la fuerza se debe medir fuera para maximizar la eficacia de este método de secuencia) será necesitado en el teórico (el modelo desarrollado por Rosa, Di Ventra y Micheletti es mesoscopic, no atomístico) y en el nivel experimental.

Más detalladamente…

Nanoporesequencing es una técnica innovadora, una opción a métodos más tradicionales tales como PCA. Este método implica el separar de los dos hilos del nucleobase que componen el doble hélice de la DNA y de analizarlos uno por uno. Cada hilo se impulsa a través de un nanopore mientras que las variaciones eléctricas en el desplazamiento se registran. Eso es un método electroquímico: los cambios en el campo eléctrico dan la información sobre la composición química de la molécula impulsada a través del poro y la composición se reconstruye así. Este método ha rendido Hasta ahora buenos resultados con los fragmentos cortos de la DNA, mientras que las dificultades se han encontrado para las más largas, debido a los nudos. Por eso estudia por ejemplo Rosa, Di Ventra y Micheletti es un paso de progresión importante para aumentar su eficiencia.

Fuente: http://www.sissa.it

Last Update: 9. November 2012 07:32

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