Site Sponsors
  • Strem Chemicals - Nanomaterials for R&D
  • Park Systems - Manufacturer of a complete range of AFM solutions
  • Oxford Instruments Nanoanalysis - X-Max Large Area Analytical EDS SDD

Innovativt Modellera Ger Nya Inblickar in i Nanopore Ordnande i viss följd

Published on November 9, 2012 at 6:46 AM

Som nanotechnology fortskrider, blir det mer och mer viktigt att veta in specificerar dynamiken av nanoworlden (världen på fjäll av ett miljonte av en millimeter). Händer Vad, till exempel, när oss försök att köra en polyelectrolyte (kedjar ett långt av elektriskt laddade molekylar, liksom DNA), till och med en nanopore, om fnurror orsakar translocationen som är processaa till driftstopp?

Det är inte ett pointless ifrågasätter, därför att nu en ny DNA-ordnande i viss följdmetod som electrochemically analyserar varje singel, strandar, genom att köra den till och med en nanopore, framkallas. Ansa till tova upp, om de är mycket långa, Sedan de strandar, Angelo som Rosa av Landskampen Skolar för Avancerade Studier och hans kollegauppsättning ut till studien dynamiken av denna translocation teoretiskt, genom att bära ut en simulering.

Modellera som väljs av forskarna har visat, att att sitta fast inte orsakas av den bara närvaroen av fnurran, men av förhållandet mellan friktion och styrkan som appliceras för att köra molekylen in i mellanrummet. ”Är resultatet inte så tydligt, om jämfört till vad händer på en jämn makro,” förklarade Cristian Micheletti, forskare på SISSA, och en av författarna av det pappers- som publiceras i Läkarundersökning, Granskar Märker. ”Introducerar Fnurror en effektiv friktion som förhöjningar med den applicerade styrkan och handtagen polymern till andra sidan av nanoporen. Translocation stannas endast ovanför en ingångsstyrka”.

”Enligt vad vi observerade i simuleringen, att undvika blockeringen av por och stopp av translocationen, bör den applicerade styrkan kontrolleras, utan att dra för mycket” förklarade Rosa.

Denna studie är precis en första steg. För kvantitativt specificerar på detta ska processaa (vad denna ingång är och hur styrkan bör mätas ut för att maximera effektiviteten av denna ordnande i viss följdmetod), mer djupgående undersökningar behövs både på det teoretiskt (modellera som framkallas av Rosa, är Di Ventra och Micheletti mesoscopic, inte atomistic), och på det experimentellt jämna.

Mer specificerar in…,

Nanoporesequencing är en innovativ teknik, ett alternativ till traditionellare metoder liksom PCA. Denna metod gäller att avskilja tvåna som nucleobasen strandar, som sminket den dubbla spiralen av DNAEN och analysering dem en vid en. Varje strandar är drivande till och med en nanopore, som de elektriska variationerna i translocationen antecknas. Det är en electrochemical metod: förändringar i elkraften sätter in ger information på den kemiska sammansättningen av molekylen som är drivande till och med por, och sammansättningen rekonstrueras thus. Upp till nu har har denna metod givit bra resultat med kort stavelseDNA-fragment, stundsvårigheter mötts för längre, på grund av fnurrorna. Det är därför studier liksom Rosa, Di Ventra och Michelettis är ett viktigt kliver till förhöjning dess effektivitet.

Källa: http://www.sissa.it

Last Update: 9. November 2012 07:32

Tell Us What You Think

Do you have a review, update or anything you would like to add to this news story?

Leave your feedback
Submit