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創新設計提供新的答案到 Nanopore 排序

Published on November 9, 2012 at 6:46 AM

當納米技術繼續進行,變得愈加重要詳細認識 nanoworld (在縮放比例的世界的動力百萬分之一分之一一毫米)。 例如,什麼發生,當我們設法通過 nanopore 駕駛高分子電解質 (電子被充電的分子長鏈,例如脫氧核糖核酸) 時,如果結造成遷移進程阻塞?

它不是一個無意義的問題,因為現在排序方法的新的脫氧核糖核酸電化學上通過驅動它分析每一條子線通過 nanopore,被開發。 因為那些子線傾向於纏結,如果他們是非常長的,國際學校的安吉洛羅莎為高級研究和他的同事的下決心通過執行模擬理論上學習此遷移動力。

科學家選擇的這個設計由摩擦和被應用的強制之間的關係向顯示堵塞沒有造成由這個結的僅僅出現,但是驅動這個分子到這個空白。「結果對什麼不是那麼顯然的,如果比較發生在一個宏觀級別」,解釋了 Cristian Micheletti,本文的作者的 SISSA 的研究員和一在實際覆核信函發布的。 「結引入增量用應用的強制和下拉式對 nanopore 的另一個端的聚合物的有效摩擦。 遷移在閾值強制上只止步不前」。

「根據什麼我們在模擬觀察了,避免這個毛孔的遷移的阻礙和止步不前,被應用的強制應該是受控的,无需拉許多」解釋的羅莎。

此研究是第一步。 對於在此進程 (什麼此閾值是,并且如何應該按量配給強制最大化此排序的方法的效果) 更加詳細的考試中的定量詳細資料必要在理論上 (羅莎開發的設計, Di Ventra,并且 Micheletti mesoscopic,不原子論) 和在這個實驗級別。

詳細…

Nanoporesequencing 是一個創新技術,對更加傳統的方法的替代例如 PCA。 此方法介入分隔組成雙重螺旋脫氧核糖核酸和逐個分析他們的二條 nucleobase 子線。 當在遷移上的電變化被記錄,每條子線通過 nanopore 被驅動。 那是一個電化學方法: 在這個電場的改變提供關於通過這個毛孔被驅動的這個分子的化學成分的信息,并且構成因而重建。 此方法到現在產生了與短的脫氧核糖核酸片段的好結果,而困難為更長那些遇到了,由於結。 所以學習例如羅莎, Di Ventra,并且 Micheletti 的是增加其效率的一個重要步驟。

來源: http://www.sissa.it

Last Update: 9. November 2012 07:29

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