Posted in | Nanomaterials | Dendrimers

Работа Исследователей на Вычислительных Инструментах Химии для Пользы в Суперкомпьютере Голубых Вод

Published on April 28, 2010 at 4:40 AM

Они не могут ждать для того чтобы сделать вычислительную химию на вычислениях quadrillion в секунду.

Но нет полностью той производительности компьютера которая управляет Государственным Университетом 3 Айова и исследователями Лаборатории Ames по мере того как они начинают вычислительную химию на petascale. Управлять их проектом способность работать сложные вычисления и улучшает науку.

«Сила Petascale необходима для точности,» сказал Монику Lamm, ассистента профессора Положения Айовы химического и биологического научного работника инженерства и сподвижницы на Министерстве Энергетики США Лаборатория Ames Которая изучает сложную молекулярную вязку. «Теперь мы должны использовать методы которые более менее точны и более менее надежны.»

Тереза Windus, профессор Положения Айовы химии и сподвижница Лаборатории Ames, сказало что более высокая производительность компьютера внесет изменения большой в ее изучениях атмосферических частиц: «Это позволяет нам получить результаты мы никогда не имели раньше.»

Источник новой и улучшенной производительности компьютера Голубые Воды, суперкомпьютер который развивается как совместные усилия Университета Иллинойсаа на Урбана-Шампаре, свой Национальный Центр для Применений Супервычислительного, IBM, и Консорциум Великих озер для Вычисления Petascale, которое включает Положение Айовы.

Ожидано, что будут Голубые Воды самым мощным суперкомпьютером в мире для открытого научного исследования когда оно приходит он-лайн в 2011. Будет первой системой своего вида для того чтобы вытерпеть одно представление petaflop - вычисления одного quadrillion в секунду - на ряде применений науки и инженерства.

Голубые Воды поддержаны Национальным фондом и Университетом Иллинойсаа.

Исследователя Lamm, Windus и Марк Гордон, Выдающийся Профессор и Фрэнсис M. Craig Стул Положения Айовы в химии, химике Лаборатории Ames старших и директоре Прикладной Математики лаборатории И Вычислительных Наук Программы, водят работу Положения Айовы для того чтобы начать вычислительное ПО химии которое можно вычислить по маштабу до компьютерных систем petascale. Научно-исследовательская группа также включает Masha Sosonkina, адъюнкта-профессора адъюнкта компьутерных наук, компьютерной инженерии электрических и и научного работника Лаборатории Ames; и Brett Обещает, менеджер разработки программного обеспечения для проекта Голубых Вод на Национальном Центре для Применений Супервычислительного.

Работа исследователей поддержана дарами больше чем $1,6 миллиона от Национального фонда.

Исследователя Положения Айовы работают для того чтобы вычислить по маштабу вверх 2 вычислительных Кода ПО химии для пользы на Голубых Водах и своих тысячах параллельных обработчиков и высокоскоростных соединений. («Вы как раз не кладете КОМПАКТНЫЙ ДИСК в компьютер и удар устанавливает,» Windus сказало.) Кодов вызывать GAMESS и было начато исследовательской группой Гордона на Лаборатории Ames и Положении Айовы; другое NWChem, для которого Windus было проявителем руководства когда она была на Министерстве Энергетики США Лаборатория Тихая Океан Северо-западная Национальная в Richland, Вашингтоне. Ожидано, что помогает производительность компьютера Голубых Вод ПО для того чтобы поставить более лучше, более точные ответы до 3 специфических проблемы исследования которая слишком вычислительно требовали сделать полномасштабные вычисления с настоящими инструментами исследования.

Lamm изучает как dendrimers (большие полимеры с много ветвей) связывают к лигандам (более малым молекулам которые связывают с другими молекулами для того чтобы сформировать более большие комплексы). Более лучшее вникание вязки смогло иметь применения в технологиях здоровья как поставка и водоочистка снадобья.

Windus изучает аэрозоли в атмосфере и как малюсенькие частицы растут на молекулярном уровне. Она сказала что более лучшее вникание аэрозолей важно к понимать химию атмосферы. Она использует NWChem для исследования.

Гордон изучает молекулярную динамику воды потому что много понятых аспектов своего поведения очень хорошие. Для того чтобы сделать его изучения, он использует вычислительный метод который позволяет исследователям посмотреть большую молекулярную систему путем разделять ее в части. То позволяет исследователям сделать более быстрые вычисления пока поддерживающ точные результаты. Метод только доступен на инструменте химии GAMESS вычислительном развитом Гордоном и его исследовательской группой.

Lamm сказало что она надеется проект Голубых Вод поможет Айове Заявить исследователей для того чтобы двинуть их проекты вперед.

«Проблема вычислительной химии имеет, котор будут спрашивать какая производительность компьютера доступно и как можем мы упростить науку для компьютера,» ей сказала. «Теперь мы имеем шанс сделать наши проблемы правый путь.»

Источник: http://www.iastate.edu/

Last Update: 12. January 2012 23:43

Tell Us What You Think

Do you have a review, update or anything you would like to add to this news story?

Leave your feedback
Submit