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El Estudio Aumenta Duda en Viabilidad del Genoma Funcional de Nanopore Que Ordena el Dispositivo

Published on October 18, 2012 at 8:51 AM

La reclamación que la tecnología del nanopore está al borde de hacer el análisis de la DNA tan rápido y barato que el genoma entero de una persona se podría ordenar en apenas minutos y en una parte del costo de métodos comerciales disponibles, ha dado lugar a interés académico, industrial, y global el abrumar.

Pero una revista del físico Del Noreste Meni Wanunu de la Universidad, publicado en una edición especial en el nanopore que ordena en la Física de las Revistas de la Vida, pregunta si los obstáculos técnicos restantes se pueden vencer para crear un dispositivo comercial realizable, fácilmente producido.

A principios de este año Tecnologías de Oxford Nanopore, una de las compañías pioneras de ordenar descubrimientos, anunciadas que cuentan con el hilo del nanopore que ordena para lograr un genoma minucioso 15 en 2014 en un costo de $1.500. Esto es muy diferente de los $10 millones que costó para ordenar un genoma entero hace apenas 5 años.

Desde Que la idea de la secuencia del nanopore era en mediados de 1990 s primero propuesto, se han hecho los avances enormes. La idea básica es excesivamente simple: una única cuerda de rosca de la DNA se pasa con molécula-haber clasificado minúscula agujero-o nanopore-y las diversas bases de la DNA se determinan en orden mientras que se mueven a través del poro.

Pero según Wanunu, la realidad de la tecnología de manipulación basada en los poros tan minúsculos que 25.000 de ellos pueden ajustar de lado a lado en un cabello humano ha probado una tarea de enormes proporciones. El reto principal ha sido reducir el proceso y controlar el movimiento del hilo de la DNA a través del poro a un tipo bastante lento para hacer bases individuales de la DNA legibles y usables. Una nueva aproximación usando el movimiento enzima-controlado, desarrollado para superar este problema, tiene sus propias desventajas incluyendo actividad enzimática pobre dando por resultado processivity limitado y el movimiento delantero-reverso incontrolado.

Otro dilema importante ha sido si la proteína o los poros de estado sólido proporciona a la técnica más prometedora. Al principio, las proteínas porosas naturales fueron investigadas. Pero en el 2000s temprano, anunciado como mejores capacidad y adaptabilidad de ofrecimiento, los diversos nanopores de estado sólido hechos del silicio o el graphene fueron probados. “Desde los canales lípido-embutidos de la proteína y los nanopores de estado sólido tenga desventajas, será interesante ver qué dispositivo, o qué combinación de dispositivos, estará disponible en próximos años, eventualmente,” Wanunu dice.

En este tiempo todavía hay muchos obstáculos a vencer, él agrega, incluyendo la incapacidad de nanopores para proporcionar a cualquier información espectroscópica sobre la identidad de una molécula, incertidumbres sobre si el desplazamiento ocurre a una velocidad constante, y las complicaciones de la obstrucción del poro.

Escribiendo en un comentario publicado en la misma edición, Juan Kasianowicz del National Institute of Standards and Technology en los E.E.U.U., pionero en el campo, está de acuerdo que sigue habiendo el un montón de retos: “Todavía hay de hecho muchos problemas a dirigir para activar los dispositivos que detectan nanopore-basados electrónicos prácticos. Sin Embargo, mejor entendiendo el camino desarrollado ya en este campo naciente, el viaje esperanzadamente aparecerá un poco menos desalentador,”

En un comentario final sobre la revista de Wanunu, el fundador y el Director de Oxford Nanopore, Hagan Bayley, anticipa al futuro: “A más largo plazo, usando poros de estado sólido… puede ser posible leer series de la DNA en los microsegundos bastante que milisegundos por base. Esto se podría hacer usando corrientes el hacer un túnel u otras características de las bases de la DNA para las cuales graphene-con su electrónico inusual propiedad-pudo después de que el revelado adicional proporcione a un substrato superior y al obrar así entregue otro salto masivo hacia adelante encima de una década de progreso sin precedente.”

Fuente: http://www.elsevier.com

Last Update: 18. October 2012 09:47

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