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研究提高在排序设备的功能 Nanopore 染色体的生活能力的怀疑

Published on October 18, 2012 at 8:51 AM

索赔 nanopore 技术是在使人员的整个染色体可能排序在分钟和在可用的商业方法的一小部分费用的脱氧核糖核酸分析的边缘很快速和便宜,导致巨大学术,行业和全球利息。

但是由东北大学物理学家 Meni Wanunu 的复核,发布在排序在生活复核物理的 nanopore 的一个特别问题,询问是否剩余的技术障碍可以解决创建一个可使用,容易地导致的商业设备。

今年初牛津 Nanopore 技术,其中一家排序发现作早期工作在的公司,宣布他们期待排序 nanopore 的子线在 2014年之前达到 15 分钟染色体在一费用的 $1,500。 这是花费排序一条整个染色体 5 年前从 $10 百万的相差很远。

自从想法 nanopore 排序在 20 世纪 90 年代中期首先建议,巨大的预付款做。 基本想法是极为简单的: 脱氧核糖核酸唯一线程数通过一微小分子尺寸漏洞或 nanopore 和多种脱氧核糖核酸基础依顺序被识别,当他们通过这个毛孔移动。

但是根据 Wanunu,在毛孔基础上的操作的技术的事实很微小 25,000 他们并行在人发可能适合证明一项艰巨的任务。 主要挑战是减速这个进程和控制脱氧核糖核酸子线的移动通过这个毛孔以足够慢的费率使各自的脱氧核糖核酸基础可读和可用。 使用酵素控制移动的一个新的途径,被开发克服此问题,有其自己的缺点包括粗劣的酶活性造成有限 processivity 和未管制的转接反向行动。

另一个专业难题是蛋白质或固体毛孔是否提供这个最有为的技术。 起初,自然发生的多孔蛋白质调查。 但是在这个早 2000s,被宣布作为提供的更好的功能和灵活性,多种固体 nanopores 由硅制成或 graphene 被测试了。 “从油脂嵌入蛋白质通道和固体 nanopores 请有缺点,发现将是有趣的哪个设备,或者设备的什么组合,在将来几年将是可用的,若有”, Wanunu 说。

此时仍有解决的许多障碍,他添加,包括 nanopores 的无能力关于分子的身分,不确定性关于迁移是否发生以匀速和毛孔堵塞的复杂化的所有分光镜情报。

写在同一个问题发布的备注,从国家标准技术局的约翰 Kasianowicz 在美国,在这个域的一个先驱,同意大量挑战依然存在: “仍然的确有解决的许多问题为了启用实用的电子基于 nanopore 的传感器。 然而,将通过好了解在此出生域已经发展的路,这次旅途有希望地出现有点较不吓人”,

在关于 Wanunu 的复核的最终备注,牛津 Nanopore, Hagan Bayley 的创建者和主任,朝前看对远期: “在较长时期内,通过使用固体毛孔…读脱氧核糖核酸顺序在微秒而不是毫秒每个基础可能是可能的。 这可能执行通过使用挖洞当前或 graphene 与其异常电子属性可能脱氧核糖核酸基础的其他特性,在另外的发展提供一个优越基体和今后这样作提供另一个大量飞跃在十年史无前例的进展顶部后”。

来源: http://www.elsevier.com

Last Update: 18. October 2012 09:44

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